Дьяков М.С. Программный пакет для генетического анализа сложных количественных признаков

Магистерская диссертация по направлению высшего профессионального образования 230100.68 Информатика и вычислительная техника.
- Новосибирск: НГУ, 2010. – 33 с. Содержание
Предметная область.
Многомерная регрессия.
Метод диаллельных скрещиваний.
Анализ сцепления модельных локусов с маркерами хромосом.
Постановка задачи.
Цель работы.
Входные данные.
Алгоритмы решения задачи.
Построение модели.
Кодирование решения.
Определение качества решения линейной регрессии.
Линейная многомерная регрессия.
Метод квадратных корней.
Перебор пространства решений.
Обзор полученного метода.
Описание метода.
Установление сцепления модельных локусов с маркерами хромосом.
Трехлокусное сцепление, одномерный случай.
Трехлокусное сцепление, многомерный случай.
Поиск всех точек сцепления.
Тест на сходство предсказанного и наблюдаемого распределений значения признака в F2.
Определение генотипа модельных локусов в F2.
Поиск решений на основе объединенных экспериментальных данных.
Перестановочный тест.
Рекомендации по выбору модели.
Описание программной системы.
Компоненты программного пакета.
Поиск решений на основе данных о диаллельных скрещиваниях.
Поиск решений на основе объединенных экспериментальных данных.
Отладка и тестирование.
Тестирование.