ПолесГУ, экзамен, 60 вопросов
Организация геномов различных групп организмов. Корреляция
сложности организации организма с размером генома.
Эволюция геномов. Роль геномных перестроек, увеличения и уменьшения
размеров геномов, роль мобильных генетических элементов в этих
процессах.
Семейства гомологичных генов в геномах. Ортологи и и паралоги.
Псевдогены. Типы повторяющихся последовательностей и их
встречаемость в геномах различных организмов.
Организация хромосом различных организмов. Теломераза, механизм
репликации концов линейных хромосом.
Структура прерывистых генов у различных эукариот: размеры и число
интронов и экзонов, взаимосвязь организации генов с различиями в
механизме их экспрессии у растений и животных.
ДНК-полимеразы прокариот: размеры, субъединичный состав,
ферментативные активности и участие в процессах репликации и
репарации.
Структура ДНК-полимеразы III кишечной палочки, функции ее отдельных
субъединиц.
ДНК-полимеразы эукариот: размеры, субъединичный состав,
ферментативные активности и участие в процессах репликации и
репарации.
Модель работы димерной полимеразы; координация синтеза ДНК на
комплементарных нитях.
Роль вспомогательных белков (ДСБ, хеликаз, праймаз и лигаз) в
синтезе ДНК. Полунепрерывный синтез и фрагменты Оказаки.
Регуляция инициации репликации у E. сoli. Структура участка старта
репликации (OriС). Понятие о репликоне. Терминация репликации у
бактерий.
Репликоны у эукариот. Ori у дрожжей, их структурно-функциональная
организация. Принципы контроля инициации репликации у эукариот.
Схема синтеза ДНК в репликативной вилке у прокариот.
Топологические проблемы, связанные с репликацией ДНК. Топоизомеразы
I и II типов, механизм их действия.
Основные типы повреждений ДНК. Спонтанные и индуцируемые
повреждения.
Репарация повреждений ДНК. Фотореактивация.
Эксцизионная репарация (эксцизия нуклеотидов, оснований):
используемые ферменты и их функции.
Пострепликативная репарация. Роль метилирования в дискриминации
цепей ДНК после репликации.
Рекомбинационная репарация.
SOS-репарация. Белки Rec А и Lex А.
Рекомбинация. Общая и сайтспецифическая рекомбинация,
механизмы.
Основные типы мобильных генетических элементов про- и эукариот:
структура, гены и их продукты. Молекулярный механизм
транспозиции.
Общая схема транскрипции у прокариот. Единица транскрипции. Стадии
транскрипционного цикла.
Особенности структуры РНК-полимеразы прокариот. Кор-фермент и
холофермент.
Промотор прокариот, его структура и механизм его распознавания.
Позитивные регуляторы.
Терминация транскрипции у прокариот. Rho-зависимая и независимая
терминация транскрипции у прокариот. ПАСЬ
Транскрипция у эукариот. РНК-полимеразы I, II и III эукариот,
функции основных субъединиц.
Промоторы эукариот: размеры, положение, структура, механизм
распознавания РНК-полимеразами. Структура промотора для
РНК-полимеразы П.
Транскрипционные факторы эукариот. Инициаторные комплексы на
промоторах различных РНК-полимераз.
Терминация транскриптов эукариотических РНК-полимераз.
Общий план строения РНК.
Первичные продукты транскрипции, их характеристика. ПРОВОТОРОВА
Определение процессинга. Интроны группы I. Особенности структуры и
механизмы сплайсинга. Аутосплайсинг. Реакция трансэтерификации.
Рибозимы, их специфичность, механизм катализа. Примеры рибозимов
(L-19 РНК, РНКаза Р, «головка молотка»).
Интроны группы П: структура и механизм сплайсинга. ШТЫК
Сплайсинг пре-мРНК в ядре. Сплайсосома. мяРНК и мяРНП-частицы.
Альтернативный сплайсинг: механизмы, роль, распространение,
примеры.
Процессинг пре-мРНК. Модификация 5′ и 3′-концов транскрипта.
Значение модификации концов транскриптов. Различный эффект
полиаденилирования у прокариот и эукариот.
мРНК, ее структура и функциональные участки. ЯКУБОВСКАЯ
Процессинг пре-тРНК: формирование 5′ и 3′-концов тРНК, сплайсинг,
модификация оснований.
Рибосомальные РНК. Процессинг пре-рРНК у прокариот и эукариот.
Общая схема биосинтеза белков. ЯКУБОВСКАЯ
Генетический код. Основные свойства генетического кода.
Транспортные РНК: первичная, вторичная и третичная структура, роль
модифицированных нуклеотидов. Аминоацилирование тРНК. ГЛАДУН
Прокариотический и эукариотический типы рибосом. Рибосомные РНК и
белки, их виды и номенклатура.
Функциональные участки рибосом: мРНК-связывающий участок,
тРНК-связывающие участки А, Р и Е участки, пептидилтрансферазный
участок.
Инициация трансляции у прокариот. Инициирующие кодоны и сайт
связывания рибосом на мРНК. Инициаторная тРНК и белковые факторы
инициации.
Инициация трансляции у эукариот. Особенности эукариотической мРНК.
Кэп-структура и инициирующие кодоны. Инициаторная тРНК. Белковые
факторы инициации.
Элонгация полипептидной цепи. Фактор элонгации 1 EF-Tu или EF-1) и
поступление аминоацил-тРНК в рибосому. Реакция транспептидации.
Фактор элонгации 2 (EF-G или EF-2) и транслокация рибосомы.
Терминация трансляции: терминирующие кодоны, белковые факторы
терминации (RF1, RF, RF3), гидролиз пептидил-тРНК. Фактор RRF и
диссоциация трансляционного комплекса.
Фолдинг белков. Формирование нативной трехмерной структуры белков.
Молекулярные шрпероны семейств Hsp60 и Hsp70 у про- и эукариот.
Рабочий цикл шаперонных комплексов CroELS и DnaKJ-GrpE.
Деградация белков: АТФ-зависимые протеазы прокариот и
26S-протеасома эукариот.
Механизм распознавания аномальных белков. Система
убиквитинилирования белков эукариот.
Секреция белков у прокариот. Sec-аппарат и сигнальный пептид,
системы секреции I-IV типов.
Распределение белков по компартментам клетки эукариот.
Котрансляционная транслокация белков в полость эндоплазматического
ретикулума.
Модификации белков в полости эндоплазматического ретикулума.
Транспорт белков в митохондрии и хлоропласты, контроль локализации
белков внутри этих органелл.
Транспорт белков через ядерные поры.
Молекулярная биология
