Смиряев А.В., Панкина Л.К. Моделирование генных сетей

Учебное пособие.— Издание 2-е исправленное — М.: ФГОУ ВПО РГАУ - МСХА им. К.А. Тимирязева, 2013. — 52 с.— ISBN 978-5-9675-02224-8 Изложены принципы функционирования и методические основы моделирования генных сетей, регулирующих формирование сложных признаков и процессов прокариот и эукариот. Приведен краткий обзор баз данных, необходимых для построения моделей функционирования генных сетей. Рассмотрены графические, дискретные и непрерывные математические модели. Изложены результаты и перспективы применения этого современного направления моделирования в генетике, медицине и теории эволюции.
Пособие предназначено для подготовки магистров сельского хозяйства по направлению «Агрономия», а также для курсов повышения квалификации специалистов в области генетики, селекции и биотехнологии. Содержание Введение
Принципы функционирования и модели генных сетей
Генные сети про- и эукариот
Цели и задачи моделирования генных сетей
Классификация генных сетей и их составляющие
Построение моделей генных сетей
Базы данных
Графические схемы функционирования генных сетей
Дискретный способ моделирования генных сетей
Непрерывные модели
Проблема адекватности моделей
Методика и результаты анализа моделей генных сетей
Анализ функционирования генных сетей
Анализ влияния мутаций
Эволюция генных сетей
Заключение
Приложение 1 Некоторые базы данных по параметрам ферментативных реакций, регуляторным путям и метаболическим генным сетям (http://www.mgs.bionet.nsc.ru)
Приложение 2 Классификация методов математического моделирования динамики генных сетей, основанная на типах формализации процессов (http://www.mgs.bionet.nsc.ru)
Словарь основных терминов и понятий
Литература