относятся возбудители хламидиозов, риккетсии, вирусы и особо прихотливые бактерии. Они быстро
отмирают в почве.
Обеззараживающая   способность   разных   почв   неодинакова   и   подчас   почва   может   служить
благоприятным   субстратом   для   патогенных   микроорганизмов.   Почва   как   субстрат,   состоящий   из
твердой   фазы   и   воды,   служит   естественным   местом   обитания   для   возбудителей   многих   заразных
болезней:   клостридиозов,   сибирской   язвы,   псевдотуберкулеза,   листериоза,   лептоспироза,
эризипелоида,   туберкулеза,   мелиоидоза,   синегнойной   инфекции,   дерматомикозов,   микотоксикозов,
холеры, иерсиниоза, сальмонеллеза.
Большое   влияние,   как   на   общую   численность,   так   и   на   соотношение   отдельных
систематических   групп   микроорганизмов   оказывает   тип   почвы.   Различаясь   по   физическим   и
химическим   свойствам,   почва   представляет   различную   среду   для   жизнедеятельности
микроорганизмов. Их больше в увлажненной и обработанной почве (4,2-5,2 млрд/г), меньше в лесной
почве, в песках (0,9-1,2 млрд/г). Наиболее обильна микрофлора в верхнем горизонте почвы глубиной
2,5-15   см.   В   этом   слое   протекают   основные   биохимические   процессы   превращения   органических
веществ,   обусловленные   жизнедеятельностью   микроорганизмов.   На   глубине   4-5   м   число
микроорганизмов значительно снижается, так как уменьшается количество питательных веществ, и
ухудшаются условия аэрации
В составе микрофлоры почвы выделяют следующие группы микроорганизмов: 
1. бактерии   аммонификаторы,  вызывающие   гниение  трупов животных,   остатков   растений,
разложение мочевины с образованием аммиака и других продуктов:
2. аэробные бактерии - B . subtilis, B . mesentericus, Serratia marcescens;
3. бактерии рода Proteus;
4. грибы рода Aspergillus, Mucor, Penicillium;
5. анаэробы – C.sporogenes, C.putrificum;
6. уробактерии – Urobacillus pasteuri, Sarcina urea, расщепляющие мочевину; 
7. нитрифицирующие  бактерии:  Nitrobacter  и  Nitrosomonas  (Nitrosomonas  окисляют  аммиак
до  азотистой  кислоты,  образуя  нитриты,  Nitrobacter  превращают  азотистую  кислоту  в  азотную  и
нитраты); 
8. азотфиксирующие бактерии: усваивают из воздуха свободный кислород и в процессе своей
жизнедеятельности  из  молекулярного   азота  синтезируют  белки  и  другие   органические  соединения
азота, используемые растениями; 
9. бактерии,   участвующие   в   круговороте   серы,   железа,   фосфора   и   других   элементов   –
серобактерии,   железобактерии   и   т.д.   (серобактерии   окисляют   сероводород   до   серной   кислоты,
железобактерии   окисляют   соединения   железа   до   гидрата   окиси   железа,   фосфорные   бактерии
способствуют образованию легко растворимых соединений фосфора); 
10. бактерии, расщепляющие клетчатку и вызывающие брожение (молочнокислые, спиртовые,
маслянокислые, уксусные, протионовые и др.). 
С выделениями человека и животных, с фекальнобытовыми сточными водами в почву могут
попадать   патогенные   и   условнопатогенные   микроорганизмы   (возбудители   грибковых   заболеваний,
ботулизма,   столбняка,   газовой   гангрены,   сибирской   язвы,   бруцеллеза,   лептоспироза,   кишечных
инфекций и др.). 
Санитарно-бактериологическое исследование почвы 
Санитарное состояние почвы оценивают по коли – титру, количеству анаэробов, споровых и
термофилов, по наличию яиц гельминтов и специфических возбудителей инфекций. Для чистой почвы
титр кишечной палочки не более 1г, умеренно загрязненной – до 50 мг, для сильно загрязненной – 1-2
мг.
Обезвреживание   почвы,   обсемененной   патогенными   микроорганизмами,   проводят
механической обработкой и посевом растений. Применение химических веществ приводит к утрате
почвой плодородия.
При исследовании почвы может проводиться полный или краткий анализ. Полный санитарно-
бактериологический анализ почвы проводится: 
 для подробной и глубокой характеристики санитарного состояния почвы; 
 для   определения   пригодности   почвы   при   размещении   жилья,   мест   отдыха,   детских
учреждений и водопроводных сооружений;
 для эпидемиологических исследований. 
Краткий анализ рекомендуется при осуществлении текущего санитарного надзора и включает
определение общего количества сапрофитных бактерий, БГКП (коли-титр и коли-индекс), клостридий
(перфрингенс-титр), термофильных бактерий, нитрифицирующих.