принимал участие в празднования рожденного в Испании принца Бальтасара
в 1630 году.[10] Помогал в качестве заместителя приходского священника в
приходе Санта-Барбара, самом богатом в городе. В 1631 году Монтесинос
получил королевское разрешение (от 24 декабря) остаться в Перу на два года
больше. Что интересно в Провинциальных каталогах иезуитов за 1631 и 1636
года Монтесинос не упоминается. Но он никогда не называл себя иезуитом, а
только «Дон Фернандо де Монтесинос. Священник». В 1636—1639 он
проживал в перуанской столице Лиме и там у него был свой дом, получил
должность в Святой Канцелярии Инквизиции, и тогда же ему было поручено
написать и он напечатал обстоятельный доклад «Знаменательное Аутодафе,
проведенное в Лиме 23 января 1639» («Auto de Fe celebrado en Lima el 23 de
Enero de 1639»). В то воскресенье произошло знаменательное по своему
событие: сразу восемьдесят приговорѐнных было осуждено Святой
Инквизицией, двенадцать были сожжены — среди них девять являлись
португальцами; в основном приговорѐнными были еврейские торговцы;
произошло это в месте, названном Каменистая местность (el Pedregal), на
дороге в Аманкаес (Amancaes). Это был самый кровавый эпизод в новой
истории Перу. Также это было первое аутодафе в Перу, хотя Инквизиция
была установлена в столице в 1570 году. Вышеупомянутый доклад был
повторно напечатан в Мадридском Семинарском Еженедельнике (Semanario
Erudito de Madrid) 7 февраля 1640 года.
Инквизиция сыграла ключевую роль в становлении взглядов
Монтесиноса на завоевание испанцами инков, и превознесение роли
католической церкви перед местной религией. Также он никогда не
упоминал, что напрямую общался с индейцами, а только с испанцами и
креолами, в основном же со священниками.
В 1640 году он едет в Андавайлас (селение Кочаркас) на Святую
Неделю. В 1641 году он едет в Кахамарку.